Ebpay

    产品与服务
    PRODUCTS & SERVICE

    lncRNA

    • 产品简介
    • 技术流程
    • 样本要求
    • FAQ

    长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA,位于细胞核或胞质内。lncRNA起初被认为转录的“噪音”,而后越来越多的研究表明,lncRNA 在众多生命活动过程中发挥重要作用,lncRNA因此引起人们广泛的关注。lncRNA测序技术也随之广泛应用于基因表达调控、物种进化、物质代谢以及环境抗逆等研究。

    产品优势
    • 经验丰富
      提取成功率85%+,建库成功率95%+,物种覆盖多,项目经验2,000+
    • 实验技术成熟
      采用官方建库试剂盒,rRNA残留率<10%,且稳定
    • 专业的实验/分析团队
      实验/分析团队经验丰富,其中生信人员平均专注转录调控领域5年+
    • 一站式服务
      售前方案设计,售中异常解决,售后个性化分析,多方位服务
    产品特点
    • 可预测新的lncRNA
      既可鉴定已知的lncRNA,又可以预测新的lncRNA
    • 组学分析
      lncRNA+mRNA、lncRNA+miRNA、全转录组、lncRNA+表观等
    • 三位一体
      三位一体的转录组分析解决方案(lncRNA-mRNA-circRNA)
    应用领域
    • 环境胁迫
    • 转录调控
    • 分子标记
    • 生长发育等


    产品类型测序平台及策略推荐数据量数据质量
    去核糖体链特异性文库

    二代测序 PE150

    ≥12 GQ30≥85%

    产品类型样品要求
    lncRNA样品需求量

    动物样品:≥0.5 μg

    植物叶片、茎类样品≥0.5 μg

    样品浓度

    动物样品:≥60 ng/μl

    植物叶片、茎类样品≥30 ng/μl

    样品纯度
    OD260/280=1.8~2.2
    RNA完整性

    植物样品RIN≥5.5

    动物样品RIN≥5.8

       
    • Q:什么是长链非编码RNA?以及它们的作用?
      A:
      哺乳动物基因组序列中约5%~10%被稳定转录,蛋白质编码基因仅约占1%,其余4%~9%的序列都转录为非编码RNA。而非编码RNA(non-coding RNA)是指不能翻译为蛋白的功能性RNA分子。长链非编码RNA为这4%~9%中长度大于200 nt的非编码RNA。它们的作用主要体现在四个方面:第一,影响周边基因的表达;第二,调控蛋白质活动及定位;第三,产生小分子RNA;第四,对其他RNA的调控作用。

    • Q:rRNA的去除方法有哪些?
      A:
      有些long non-coding RNA有polyA尾,有些没有,为了保证能够取得所有long non-coding RNA,就不能用oligodT标记磁珠进行富集,只能用去rRNA试剂盒去除核糖体RNA。不同物种rRNA去除效果跟试剂盒中所使用探针的匹配程度有很大相关,如果去除效果不好,需要加大测序数据量达到相应的clean data。

    • Q:long non-coding RNA为什么构建链特异性文库?
      A:
      很多基因组区域具有正负链的转录本,反义转录是真核基因的一个特征,是一种重要的调控方式。使用ssRNA-Seq(Strand-Specific)能够保留RNA的方向性信息,可以确定转录本来自正链还是负链,以便更加准确的取得基因的结构以及基因表达信息。